Специфика взаимодействия с каждым контролирующим государственным органом несёт определённые риски по времени и возможным финансовым затратам. В Международных морских пунктах пропуска и терминалах это время обходится очень дорого, так как штрафные механизмы и перемещение, хранения контейнера приводят к дополнительным финансовым затратам. Подкарантинные и ветеринарные грузы находятся под особым контролем, поэтому ошибка, задержка, некомпетентность может привести не только к дополнительным затратам, но и запрету ввоза контейнера с грузом на территорию России (ЕАЭС). Например, не предоставления документов в течение трёх суток с момента комиссионного оформления судна на подкарантинные грузы, ставит запрет ввоза контейнера с грузом. Поэтому специализация и взаимодействия с двумя контролирующими органами, в лице Таможни и Россельхознадзора, на площадке Терминалов порта требует высокого профессионализма, доверия со стороны Заказчика к Исполнителю.